Index

A

AATS (class in mordred.Autocorrelation) AATSC (class in mordred.Autocorrelation) ABCGGIndex (class in mordred.ABCIndex) ABCIndex (class in mordred.ABCIndex) AcidicGroupCount (class in mordred.AcidBase) AdjacencyMatrix (class in mordred.AdjacencyMatrix) aggr_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) all_descriptors() (in module mordred) APol (class in mordred.Polarizability)

AromaticAtomsCount (class in mordred.Aromatic) AromaticBondsCount (class in mordred.Aromatic) as_argument (mordred.Descriptor attribute) AtomCount (class in mordred.AtomCount) atomic_sa() (mordred.surface_area.SurfaceArea method) AtomTypeEState (class in mordred.EState) ATS (class in mordred.Autocorrelation) ATSC (class in mordred.Autocorrelation) axes (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute)

B

BalabanJ (class in mordred.BalabanJ) BaryszMatrix (class in mordred.BaryszMatrix) BasicGroupCount (class in mordred.AcidBase) BCUT (class in mordred.BCUT) BertzCT (class in mordred.BertzCT)

beta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) bond_types (mordred.BondCount.BondCount attribute) BondCount (class in mordred.BondCount) BondingIC (class in mordred.InformationContent) BPol (class in mordred.Polarizability)

C

calculate() (mordred.Descriptor method) Calculator (class in mordred) CarbonTypes (class in mordred.CarbonTypes) Chi (class in mordred.Chi) chi_types (mordred.Chi.Chi attribute)

compat_atoms (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) ComplementaryIC (class in mordred.InformationContent) ConstitutionalMean (class in mordred.Constitutional) ConstitutionalSum (class in mordred.Constitutional) coord (mordred.Descriptor attribute)

D

delta_epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) delta_psi_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) delta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) dependencies() (mordred.Descriptor method) Descriptor (class in mordred) descriptors (mordred.Calculator attribute)

DetourIndex (class in mordred.DetourMatrix) DetourMatrix (class in mordred.DetourMatrix) Diameter (class in mordred.TopologicalIndex) Diameter3D (class in mordred.GeometricalIndex) DistanceMatrix (class in mordred.DistanceMatrix) DPSA (class in mordred.CPSA) DuplicatedDescriptorName

E

EccentricConnectivityIndex (class in mordred.EccentricConnectivityIndex) echo() (mordred.Calculator method) epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) Error (class in mordred.error) error (mordred.error.MissingValueBase attribute) es_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) EState_VSA (class in mordred.MoeType) EtaBranchingIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCompositeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCoreCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaAlpha (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaBeta (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaFunctionalityIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaShapeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaVEMCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) explicit_hydrogens (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

F

fail() (mordred.Descriptor method) FNSA (class in mordred.CPSA) FPSA (class in mordred.CPSA)

FragmentComplexity (class in mordred.FragmentComplexity) Framework (class in mordred.Framework) from_mol() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method) from_pdb() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method)

G

GATS (class in mordred.Autocorrelation) GeometricalShapeIndex (class in mordred.GeometricalIndex)

get_descriptors_from_module() (in module mordred) GhoseFilter (class in mordred.Lipinski) GravitationalIndex (class in mordred.GravitationalIndex)

H

HBondAcceptor (class in mordred.HydrogenBond) HBondDonor (class in mordred.HydrogenBond) header (mordred.error.Error attribute) (mordred.error.Missing attribute) (mordred.error.MissingValueBase attribute)

HybridizationRatio (class in mordred.CarbonTypes)

I

InformationContent (class in mordred.InformationContent)

K

k_max (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) KappaShapeIndex1 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex2 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex3 (class in mordred.KappaShapeIndex) kekulize (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

L

LabuteASA (class in mordred.MoeType)

Lipinski (class in mordred.Lipinski)

M

map() (mordred.Calculator method) MATS (class in mordred.Autocorrelation) McGowanVolume (class in mordred.McGowanVolume) Missing (class in mordred.error) Missing3DCoordinate MissingValueBase (class in mordred.error) ModifiedIC (class in mordred.InformationContent) mol (mordred.Descriptor attribute), [1] MolecularDistanceEdge (class in mordred.MolecularDistanceEdge) MolecularId (class in mordred.MolecularId) MomentOfInertia (class in mordred.MomentOfInertia) mordred (module) mordred.ABCIndex (module) mordred.AcidBase (module) mordred.AdjacencyMatrix (module) mordred.Aromatic (module) mordred.AtomCount (module) mordred.Autocorrelation (module) mordred.BalabanJ (module) mordred.BaryszMatrix (module) mordred.BCUT (module) mordred.BertzCT (module) mordred.BondCount (module) mordred.CarbonTypes (module) mordred.Chi (module) mordred.Constitutional (module) mordred.CPSA (module) mordred.descriptors (module) mordred.DetourMatrix (module) mordred.DistanceMatrix (module) mordred.EccentricConnectivityIndex (module) mordred.error (module) mordred.EState (module)

mordred.ExtendedTopochemicalAtom (module) mordred.FragmentComplexity (module) mordred.Framework (module) mordred.GeometricalIndex (module) mordred.GravitationalIndex (module) mordred.HydrogenBond (module) mordred.InformationContent (module) mordred.KappaShapeIndex (module) mordred.Lipinski (module) mordred.McGowanVolume (module) mordred.MoeType (module) mordred.MolecularDistanceEdge (module) mordred.MolecularId (module) mordred.MomentOfInertia (module) mordred.MoRSE (module) mordred.PathCount (module) mordred.Polarizability (module) mordred.RingCount (module) mordred.RotatableBond (module) mordred.SLogP (module) mordred.surface_area (module) mordred.TopologicalCharge (module) mordred.TopologicalIndex (module) mordred.TopoPSA (module) mordred.VdwVolumeABC (module) mordred.VertexAdjacencyInformation (module) mordred.WalkCount (module) mordred.Weight (module) mordred.WienerIndex (module) mordred.ZagrebIndex (module) MordredException MoRSE (class in mordred.MoRSE) MultipleFragments

P

pandas() (mordred.Calculator method) parameters() (mordred.Descriptor method) PathCount (class in mordred.PathCount) PEOE_VSA (class in mordred.MoeType)

PetitjeanIndex (class in mordred.TopologicalIndex) PetitjeanIndex3D (class in mordred.GeometricalIndex) PNSA (class in mordred.CPSA) PPSA (class in mordred.CPSA) preset() (mordred.Descriptor class method)

R

Radius (class in mordred.TopologicalIndex) Radius3D (class in mordred.GeometricalIndex) RASA (class in mordred.CPSA) register() (mordred.Calculator method) require_3D (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute) require_connected (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

rethrow_na() (mordred.Descriptor method) rethrow_zerodiv() (mordred.Descriptor method) RingCount (class in mordred.RingCount) RNCG (class in mordred.CPSA) RNCS (class in mordred.CPSA) RotatableBondsCount (class in mordred.RotatableBond) RotatableBondsRatio (class in mordred.RotatableBond) RPCG (class in mordred.CPSA) RPCS (class in mordred.CPSA) RPSA (class in mordred.CPSA) rtype (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

S

shape_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) SLogP (class in mordred.SLogP) SlogP_VSA (class in mordred.MoeType) SMARTS (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute)

SMR (class in mordred.SLogP) SMR_VSA (class in mordred.MoeType) stack (mordred.error.MissingValueBase attribute) StructuralIC (class in mordred.InformationContent) surface_area() (mordred.surface_area.SurfaceArea method) SurfaceArea (class in mordred.surface_area)

T

TASA (class in mordred.CPSA) tc_types (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) TopologicalCharge (class in mordred.TopologicalCharge)

TopologicalShapeIndex (class in mordred.TopologicalIndex) TopoPSA (class in mordred.TopoPSA) TotalIC (class in mordred.InformationContent) TPSA (class in mordred.CPSA)

V

VdwVolumeABC (class in mordred.VdwVolumeABC) versions (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute)

VertexAdjacencyInformation (class in mordred.VertexAdjacencyInformation) VSA_EState (class in mordred.MoeType)

W

WalkCount (class in mordred.WalkCount) Weight (class in mordred.Weight)

WienerIndex (class in mordred.WienerIndex) WNSA (class in mordred.CPSA) WPSA (class in mordred.CPSA)

Z

ZagrebIndex (class in mordred.ZagrebIndex)

ZModifiedIC (class in mordred.InformationContent)