Index

A

AATS (class in mordred.Autocorrelation) AATSC (class in mordred.Autocorrelation) ABCGGIndex (class in mordred.ABCIndex) ABCIndex (class in mordred.ABCIndex) AcidicGroupCount (class in mordred.AcidBase) AdjacencyMatrix (class in mordred.AdjacencyMatrix) aggr_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) APol (class in mordred.Polarizability) AromaticAtomsCount (class in mordred.Aromatic)

AromaticBondsCount (class in mordred.Aromatic) as_argument (mordred.Descriptor attribute) asdict() (mordred.Result method) AtomCount (class in mordred.AtomCount) atomic_sa() (mordred.surface_area.SurfaceArea method) AtomTypeEState (class in mordred.EState) ATS (class in mordred.Autocorrelation) ATSC (class in mordred.Autocorrelation) axes (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute)

B

BalabanJ (class in mordred.BalabanJ) BaryszMatrix (class in mordred.BaryszMatrix) BasicGroupCount (class in mordred.AcidBase) BCUT (class in mordred.BCUT) BertzCT (class in mordred.BertzCT)

beta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) bond_types (mordred.BondCount.BondCount attribute) BondCount (class in mordred.BondCount) BondingIC (class in mordred.InformationContent) BPol (class in mordred.Polarizability)

C

calculate() (mordred.Descriptor method) Calculator (class in mordred) CarbonTypes (class in mordred.CarbonTypes) Chi (class in mordred.Chi) chi_types (mordred.Chi.Chi attribute)

compat_atoms (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) ComplementaryIC (class in mordred.InformationContent) ConstitutionalMean (class in mordred.Constitutional) ConstitutionalSum (class in mordred.Constitutional) coord (mordred.Descriptor attribute)

D

delta_epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) delta_psi_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) delta_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) dependencies() (mordred.Descriptor method) description() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method)

Descriptor (class in mordred) descriptors (mordred.Calculator attribute) DetourIndex (class in mordred.DetourMatrix) DetourMatrix (class in mordred.DetourMatrix) Diameter (class in mordred.TopologicalIndex) Diameter3D (class in mordred.GeometricalIndex) DistanceMatrix (class in mordred.DistanceMatrix) DPSA (class in mordred.CPSA) drop_missing() (mordred.Result method) DuplicatedDescriptorName

E

EccentricConnectivityIndex (class in mordred.EccentricConnectivityIndex) echo() (mordred.Calculator method) epsilon_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) Error (class in mordred.error) error (mordred.error.MissingValueBase attribute) es_types (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) EState_VSA (class in mordred.MoeType) EtaBranchingIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCompositeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaCoreCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaAlpha (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaBeta (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaDeltaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaEpsilon (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaFunctionalityIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaPsi (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaShapeIndex (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) EtaVEMCount (class in mordred.ExtendedTopochemicalAtom) explicit_hydrogens (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.LogS.LogS attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) (mordred.TopologicalIndex.Radius attribute) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex attribute) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC attribute) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation attribute) (mordred.WalkCount.WalkCount attribute) (mordred.Weight.Weight attribute) (mordred.WienerIndex.WienerIndex attribute) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex attribute)

F

fail() (mordred.Descriptor method) fill_missing() (mordred.Result method) FNSA (class in mordred.CPSA) FPSA (class in mordred.CPSA) FractionCSP3 (class in mordred.CarbonTypes) FragmentComplexity (class in mordred.FragmentComplexity) Framework (class in mordred.Framework) from_json() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex class method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex class method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount class method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount class method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix class method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount class method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount class method) (mordred.AtomCount.AtomCount class method) (mordred.Autocorrelation.AATS class method) (mordred.Autocorrelation.AATSC class method) (mordred.Autocorrelation.ATS class method) (mordred.Autocorrelation.ATSC class method) (mordred.Autocorrelation.GATS class method) (mordred.Autocorrelation.MATS class method) (mordred.BCUT.BCUT class method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ class method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix class method) (mordred.BertzCT.BertzCT class method) (mordred.BondCount.BondCount class method) (mordred.CPSA.DPSA class method) (mordred.CPSA.FNSA class method) (mordred.CPSA.FPSA class method) (mordred.CPSA.PNSA class method) (mordred.CPSA.PPSA class method) (mordred.CPSA.RASA class method) (mordred.CPSA.RNCG class method) (mordred.CPSA.RNCS class method) (mordred.CPSA.RPCG class method) (mordred.CPSA.RPCS class method) (mordred.CPSA.RPSA class method) (mordred.CPSA.TASA class method) (mordred.CPSA.TPSA class method) (mordred.CPSA.WNSA class method) (mordred.CPSA.WPSA class method) (mordred.Calculator class method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes class method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 class method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio class method) (mordred.Chi.Chi class method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean class method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum class method) (mordred.Descriptor class method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex class method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix class method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix class method) (mordred.EState.AtomTypeEState class method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex class method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount class method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity class method) (mordred.Framework.Framework class method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D class method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex class method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D class method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D class method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex class method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor class method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor class method) (mordred.InformationContent.BondingIC class method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC class method) (mordred.InformationContent.InformationContent class method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC class method) (mordred.InformationContent.StructuralIC class method) (mordred.InformationContent.TotalIC class method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 class method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 class method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter class method) (mordred.Lipinski.Lipinski class method) (mordred.LogS.LogS class method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume class method) (mordred.MoRSE.MoRSE class method) (mordred.MoeType.EState_VSA class method) (mordred.MoeType.LabuteASA class method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA class method) (mordred.MoeType.SMR_VSA class method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA class method) (mordred.MoeType.VSA_EState class method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge class method) (mordred.MolecularId.MolecularId class method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia class method) (mordred.PathCount.PathCount class method) (mordred.Polarizability.APol class method) (mordred.Polarizability.BPol class method) (mordred.RingCount.RingCount class method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount class method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio class method) (mordred.SLogP.SLogP class method) (mordred.SLogP.SMR class method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA class method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge class method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter class method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex class method) (mordred.TopologicalIndex.Radius class method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex class method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC class method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation class method) (mordred.WalkCount.WalkCount class method) (mordred.Weight.Weight class method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex class method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex class method)

from_mol() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method) from_pdb() (mordred.surface_area.SurfaceArea class method)

G

GATS (class in mordred.Autocorrelation) GeometricalShapeIndex (class in mordred.GeometricalIndex) get_descriptors_from_module() (in module mordred) get_parameter_dict() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method)

GhoseFilter (class in mordred.Lipinski) GravitationalIndex (class in mordred.GravitationalIndex)

H

HBondAcceptor (class in mordred.HydrogenBond) HBondDonor (class in mordred.HydrogenBond) header (mordred.error.Error attribute) (mordred.error.Missing attribute) (mordred.error.MissingValueBase attribute)

HybridizationRatio (class in mordred.CarbonTypes)

I

InformationContent (class in mordred.InformationContent)

items() (mordred.Result method) ix (mordred.Result attribute)

K

k_max (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) KappaShapeIndex1 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex2 (class in mordred.KappaShapeIndex) KappaShapeIndex3 (class in mordred.KappaShapeIndex) kekulize (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.RASA attribute) (mordred.CPSA.RNCG attribute) (mordred.CPSA.RNCS attribute) (mordred.CPSA.RPCG attribute) (mordred.CPSA.RPCS attribute) (mordred.CPSA.RPSA attribute) (mordred.CPSA.TASA attribute) (mordred.CPSA.TPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes attribute) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 attribute) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio attribute) (mordred.Chi.Chi attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean attribute) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex attribute) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix attribute) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix attribute) (mordred.EState.AtomTypeEState attribute) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount attribute) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity attribute) (mordred.Framework.Framework attribute) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex attribute) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D attribute) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D attribute) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor attribute) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor attribute) (mordred.InformationContent.BondingIC attribute) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC attribute) (mordred.InformationContent.InformationContent attribute) (mordred.InformationContent.ModifiedIC attribute) (mordred.InformationContent.StructuralIC attribute) (mordred.InformationContent.TotalIC attribute) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 attribute) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 attribute) (mordred.Lipinski.GhoseFilter attribute) (mordred.Lipinski.Lipinski attribute) (mordred.LogS.LogS attribute) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume attribute) (mordred.MoRSE.MoRSE attribute) (mordred.MoeType.EState_VSA attribute) (mordred.MoeType.LabuteASA attribute) (mordred.MoeType.PEOE_VSA attribute) (mordred.MoeType.SMR_VSA attribute) (mordred.MoeType.SlogP_VSA attribute) (mordred.MoeType.VSA_EState attribute) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge attribute) (mordred.MolecularId.MolecularId attribute) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia attribute) (mordred.PathCount.PathCount attribute) (mordred.Polarizability.APol attribute) (mordred.Polarizability.BPol attribute) (mordred.RingCount.RingCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount attribute) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio attribute) (mordred.SLogP.SLogP attribute) (mordred.SLogP.SMR attribute) (mordred.TopoPSA.TopoPSA attribute) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) (mordred.TopologicalIndex.Diameter attribute) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex attribute) 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keys() (mordred.Result method)

L

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M

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N

name (mordred.Result attribute)

P

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R

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Result (class in mordred) rethrow_na() (mordred.Descriptor method) rethrow_zerodiv() (mordred.Descriptor method) RingCount (class in mordred.RingCount) RNCG (class in mordred.CPSA) RNCS (class in mordred.CPSA) RotatableBondsCount (class in mordred.RotatableBond) RotatableBondsRatio (class in mordred.RotatableBond) RPCG (class in mordred.CPSA) RPCS (class in mordred.CPSA) RPSA (class in mordred.CPSA) rtype (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS 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S

shape_types (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex attribute) since (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex attribute) (mordred.ABCIndex.ABCIndex attribute) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount attribute) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount attribute) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix attribute) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount attribute) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount attribute) (mordred.AtomCount.AtomCount attribute) (mordred.Autocorrelation.AATS attribute) (mordred.Autocorrelation.AATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.ATS attribute) (mordred.Autocorrelation.ATSC attribute) (mordred.Autocorrelation.GATS attribute) (mordred.Autocorrelation.MATS attribute) (mordred.BCUT.BCUT attribute) (mordred.BalabanJ.BalabanJ attribute) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix attribute) (mordred.BertzCT.BertzCT attribute) (mordred.BondCount.BondCount attribute) (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) 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T

TASA (class in mordred.CPSA) tc_types (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge attribute) to_json() (mordred.ABCIndex.ABCGGIndex method) (mordred.ABCIndex.ABCIndex method) (mordred.AcidBase.AcidicGroupCount method) (mordred.AcidBase.BasicGroupCount method) (mordred.AdjacencyMatrix.AdjacencyMatrix method) (mordred.Aromatic.AromaticAtomsCount method) (mordred.Aromatic.AromaticBondsCount method) (mordred.AtomCount.AtomCount method) (mordred.Autocorrelation.AATS method) (mordred.Autocorrelation.AATSC method) (mordred.Autocorrelation.ATS method) (mordred.Autocorrelation.ATSC method) (mordred.Autocorrelation.GATS method) (mordred.Autocorrelation.MATS method) (mordred.BCUT.BCUT method) (mordred.BalabanJ.BalabanJ method) (mordred.BaryszMatrix.BaryszMatrix method) (mordred.BertzCT.BertzCT method) (mordred.BondCount.BondCount method) (mordred.CPSA.DPSA method) (mordred.CPSA.FNSA method) (mordred.CPSA.FPSA method) (mordred.CPSA.PNSA method) (mordred.CPSA.PPSA method) (mordred.CPSA.RASA method) (mordred.CPSA.RNCG method) (mordred.CPSA.RNCS method) (mordred.CPSA.RPCG method) (mordred.CPSA.RPCS method) (mordred.CPSA.RPSA method) (mordred.CPSA.TASA method) (mordred.CPSA.TPSA method) (mordred.CPSA.WNSA method) (mordred.CPSA.WPSA method) (mordred.Calculator method) (mordred.CarbonTypes.CarbonTypes method) (mordred.CarbonTypes.FractionCSP3 method) (mordred.CarbonTypes.HybridizationRatio method) (mordred.Chi.Chi method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalMean method) (mordred.Constitutional.ConstitutionalSum method) (mordred.Descriptor method) (mordred.DetourMatrix.DetourIndex method) (mordred.DetourMatrix.DetourMatrix method) (mordred.DistanceMatrix.DistanceMatrix method) (mordred.EState.AtomTypeEState method) (mordred.EccentricConnectivityIndex.EccentricConnectivityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaBranchingIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCompositeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaCoreCount method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaAlpha method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaBeta method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaDeltaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaEpsilon method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaFunctionalityIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaPsi method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaShapeIndex method) (mordred.ExtendedTopochemicalAtom.EtaVEMCount method) (mordred.FragmentComplexity.FragmentComplexity method) (mordred.Framework.Framework method) (mordred.GeometricalIndex.Diameter3D method) (mordred.GeometricalIndex.GeometricalShapeIndex method) (mordred.GeometricalIndex.PetitjeanIndex3D method) (mordred.GeometricalIndex.Radius3D method) (mordred.GravitationalIndex.GravitationalIndex method) (mordred.HydrogenBond.HBondAcceptor method) (mordred.HydrogenBond.HBondDonor method) (mordred.InformationContent.BondingIC method) (mordred.InformationContent.ComplementaryIC method) (mordred.InformationContent.InformationContent method) (mordred.InformationContent.ModifiedIC method) (mordred.InformationContent.StructuralIC method) (mordred.InformationContent.TotalIC method) (mordred.InformationContent.ZModifiedIC method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex1 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex2 method) (mordred.KappaShapeIndex.KappaShapeIndex3 method) (mordred.Lipinski.GhoseFilter method) (mordred.Lipinski.Lipinski method) (mordred.LogS.LogS method) (mordred.McGowanVolume.McGowanVolume method) (mordred.MoRSE.MoRSE method) (mordred.MoeType.EState_VSA method) (mordred.MoeType.LabuteASA method) (mordred.MoeType.PEOE_VSA method) (mordred.MoeType.SMR_VSA method) (mordred.MoeType.SlogP_VSA method) (mordred.MoeType.VSA_EState method) (mordred.MolecularDistanceEdge.MolecularDistanceEdge method) (mordred.MolecularId.MolecularId method) (mordred.MomentOfInertia.MomentOfInertia method) (mordred.PathCount.PathCount method) (mordred.Polarizability.APol method) (mordred.Polarizability.BPol method) (mordred.RingCount.RingCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsCount method) (mordred.RotatableBond.RotatableBondsRatio method) (mordred.SLogP.SLogP method) (mordred.SLogP.SMR method) (mordred.TopoPSA.TopoPSA method) (mordred.TopologicalCharge.TopologicalCharge method) (mordred.TopologicalIndex.Diameter method) (mordred.TopologicalIndex.PetitjeanIndex method) (mordred.TopologicalIndex.Radius method) (mordred.TopologicalIndex.TopologicalShapeIndex method) (mordred.VdwVolumeABC.VdwVolumeABC method) (mordred.VertexAdjacencyInformation.VertexAdjacencyInformation method) (mordred.WalkCount.WalkCount method) (mordred.Weight.Weight method) (mordred.WienerIndex.WienerIndex method) (mordred.ZagrebIndex.ZagrebIndex method)

TopologicalCharge (class in mordred.TopologicalCharge) TopologicalShapeIndex (class in mordred.TopologicalIndex) TopoPSA (class in mordred.TopoPSA) TotalIC (class in mordred.InformationContent) TPSA (class in mordred.CPSA)

V

values() (mordred.Result method) VdwVolumeABC (class in mordred.VdwVolumeABC) versions (mordred.CPSA.DPSA attribute) (mordred.CPSA.FNSA attribute) (mordred.CPSA.FPSA attribute) (mordred.CPSA.PNSA attribute) (mordred.CPSA.PPSA attribute) (mordred.CPSA.WNSA attribute) (mordred.CPSA.WPSA attribute)

VertexAdjacencyInformation (class in mordred.VertexAdjacencyInformation) VSA_EState (class in mordred.MoeType)

W

WalkCount (class in mordred.WalkCount) Weight (class in mordred.Weight)

WienerIndex (class in mordred.WienerIndex) WNSA (class in mordred.CPSA) WPSA (class in mordred.CPSA)

Z

ZagrebIndex (class in mordred.ZagrebIndex)

ZModifiedIC (class in mordred.InformationContent)